Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Grin2bQ01097 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Grin2bQ01097 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms