Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Serpina1cQ00896 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Serpina1cQ00896 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms