Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbp4Q00724 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbp4Q00724 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms