Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SeleQ00690 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SeleQ00690 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms