Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
F8a1Q00558 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms