Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pax8Q00288 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms