Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1bP97952 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1bP97952 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms