Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
rp9P97762 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
rp9P97762 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
rp9P97762 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
rp9P97762 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
rp9P97762 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms