Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gata5P97489 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata5P97489 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gata5P97489 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gata5P97489 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms