Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bop1P97452 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bop1P97452 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms