Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crmp1P97427 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms