Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lig3P97386 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lig3P97386 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms