Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhodP97348 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhodP97348 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhodP97348 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RhodP97348 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RhodP97348 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms