Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Otx1P80205 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Otx1P80205 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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