Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Casp3P70677 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp3P70677 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp3P70677 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp3P70677 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms