Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Irf3P70671 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf3P70671 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms