Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tp53bp1P70399 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tp53bp1P70399 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms