Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgf11P70378 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms