Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms