Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chl1P70232 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chl1P70232 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chl1P70232 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms