Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf6P70196 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms