Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SbdsP70122 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SbdsP70122 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms