Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubb4bP68372 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms