Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tuba4aP68368 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms