Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabrb3P63080 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrb3P63080 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms