Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps27aP62983 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps27aP62983 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms