Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2bP62915 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gtf2bP62915 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms