Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rps3P62908 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rps3P62908 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rps3P62908 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rps3P62908 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms