Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vsnl1P62761 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms