Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou3f4P62515 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou3f4P62515 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms