Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tbpl1P62340 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tbpl1P62340 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms