Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rps29P62274 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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