Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lmo4P61969 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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