Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Depdc5P61460 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.76■■□□□ 1.56
Depdc5P61460 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Depdc5P61460 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms