Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Abce1P61222 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms