Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Taf13P61216 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Taf13P61216 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms