Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arf3P61205 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms