Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf1P61148 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf1P61148 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms