Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2d1P61080 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms