Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup43P59235 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms