Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scarf2P59222 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scarf2P59222 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms