Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdrg1P59048 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdrg1P59048 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms