Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rhbdl3P58873 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rhbdl3P58873 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms