Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paxbp1P58501 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paxbp1P58501 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms