Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Snrpa1P57784 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpa1P57784 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpa1P57784 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpa1P57784 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpa1P57784 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpa1P57784 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms