Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lim2P56563 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms