Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp5P56399 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp5P56399 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms