Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Atp5eP56382 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Atp5eP56382 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms