Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GemP55041 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GemP55041 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GemP55041 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GemP55041 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GemP55041 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GemP55041 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GemP55041 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms