Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PctpP53808 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PctpP53808 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PctpP53808 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PctpP53808 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PctpP53808 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PctpP53808 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PctpP53808 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms